在防治鸡大肠杆菌病方面，随投放用药种类及数量的增多，致病菌大肠杆菌的耐药性是越来越强。而研制抗菌药的速度，明显要滞后于耐药性产生的速度。而且，现阶段市场上禽产品出口的质量要求是越来越高，药物残留标准的监测同样控制的较严。如此，很大程度上，决定着“药物防治大肠杆菌病”的落后。今后此病的防治，应着力向如下几点靠拢：
4.1 微生态制剂防治
研究证实：在鸡群消化道、呼吸道、生殖道等处黏膜分布着致密的菌群，这些菌群是抵御外来致病菌侵蚀的天然屏障。微生态制剂的使用，对有益菌群起到很好的保护作用，对致病菌群而言则起到“打击”的作用，将其成为劣势菌，达到降低发病率的目的。由此，今后微生态制剂的使用，在防治此病方面将起到举足轻重的作用。
4.2 净化鸡场环境防治
多年以来，致病菌抗药性的增强，单纯“药防”是越来越被动。适应市场“绿色”食品发展需求，确保养殖户主利益最大化，防治此病由“药控”向“环境控制”，有其现实的必要性。而且，作为重要的条件性疾病，通过环境净化，切断致病菌传播途径，消除此病诱因，能更好地防控此病发生。实现鸡场环境向标准化过渡，科学选址，合理布局，标注规划，确保生产合理有序。严格消毒管理，加强通风，安装换气扇，清洁鸡舍，冬季保暖，夏季防暑，制定严格的卫生消毒程序。力求通过各方努力，达到净化鸡场，防控此病的目的。
4.3 科学规范合理药防施治
在治疗鸡大肠杆菌病方面，抗生素仍然为重要的防治武器。但是，避免耐药性的产生，科学规范合理药防施治，是极为重要和现实的。由此，用药施治期间，应遵循如下基本原则：查明病因，正确诊断，及早用药，对症施治；准确把握剂量，合理用药规程，根据施药标准用药；选择给药途径，切合抗生素自身属性，病情的轻重缓急，综合考虑耐药性、配伍禁忌等问题，确保投药的科学合理。
鸡大肠杆菌病的治疗，需花费额外的医用成本，增加养殖成本的输出。由此，提前药防，通过饮水中长期投喂水质净化剂水勿忧杀灭饮水中的大肠杆菌，达到防控感染、降低病死率的目的。
4.4 治疗措施
合理规范用药防控，能有效增强鸡群抗病体质，提升鸡群饲料转化率，降低此病感染后病死率。另一方面，经药物防控此病，同样能改善蛋鸡产蛋品质，降低此病垂直感染的概率。黄霉素，按5%～8%的比例混饲；新肥素220，按30%～70%的比例混饲；金霉素，按50%～80%的比例混饲；杆菌肽锌，按50%～100%的比例混饮；粘杆菌素在饮水中，加20～60mg/kg混饮。雏鸡防控此病，用丁胺卡那注射液，每次每只2000单位，肌肉注射，适用于进雏第一天，防控效果较好。
对于久治不愈的鸡可试选中药有：黄芩、大青叶、蒲公英、马齿苋、白头翁各 30 g，柴胡 15g，茵陈、白术、地榆、茯苓、神曲各 20 g，水煎两次，取汁待温放入鸡群中自饮或拌入饲料中饲喂，1 剂可供 100 只鸡服用，连用 3d，病重鸡可灌服 100 ml左右。用此方法预防和治疗蛋鸡和肉鸡，能有效地控制大肠杆菌病。
